Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 GLDC-216ENST00000639639 1559 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 CKS2-201ENST00000314355 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 NR0B1-201ENST00000378963 475 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 SOD1-202ENST00000389995 865 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 POLR3DP1-201ENST00000398689 1176 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 NOS2P3-201ENST00000411468 867 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 IL6RP1-201ENST00000417848 1273 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01494-201ENST00000419511 1011 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP20-2Q3LI61 ATP6V1B1-AS1-201ENST00000422761 1129 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.6 ms