Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SGSM1Q2NKQ1 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms