Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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