Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms