Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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LAPTM4AQ15012 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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LAPTM4AQ15012 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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LAPTM4AQ15012 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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LAPTM4AQ15012 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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LAPTM4AQ15012 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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LAPTM4AQ15012 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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LAPTM4AQ15012 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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