Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms