Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CUL3Q13618 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CUL3Q13618 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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