Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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