Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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