Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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FOXC1Q12948 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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FOXC1Q12948 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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FOXC1Q12948 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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FOXC1Q12948 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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FOXC1Q12948 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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FOXC1Q12948 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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FOXC1Q12948 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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FOXC1Q12948 AC092809.4-201ENST00000420350 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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FOXC1Q12948 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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FOXC1Q12948 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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