Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms