Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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SCN1BQ07699 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN1BQ07699 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN1BQ07699 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN1BQ07699 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN1BQ07699 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN1BQ07699 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN1BQ07699 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN1BQ07699 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN1BQ07699 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN1BQ07699 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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SCN1BQ07699 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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SCN1BQ07699 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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SCN1BQ07699 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN1BQ07699 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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SCN1BQ07699 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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SCN1BQ07699 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN1BQ07699 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN1BQ07699 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN1BQ07699 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN1BQ07699 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN1BQ07699 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN1BQ07699 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCN1BQ07699 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCN1BQ07699 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCN1BQ07699 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCN1BQ07699 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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