Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms