Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms