Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms