Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms