Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms