Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms