Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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FAM3AP98173 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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FAM3AP98173 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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FAM3AP98173 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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FAM3AP98173 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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FAM3AP98173 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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FAM3AP98173 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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