Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG7P83436 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG7P83436 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG7P83436 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG7P83436 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG7P83436 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG7P83436 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG7P83436 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG7P83436 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG7P83436 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG7P83436 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG7P83436 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG7P83436 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG7P83436 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG7P83436 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG7P83436 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG7P83436 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG7P83436 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG7P83436 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG7P83436 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG7P83436 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG7P83436 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms