Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms