Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms