Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms