Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms