Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI2P48788 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNNI2P48788 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNNI2P48788 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNNI2P48788 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNNI2P48788 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNNI2P48788 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNNI2P48788 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNNI2P48788 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNNI2P48788 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNNI2P48788 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNNI2P48788 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNNI2P48788 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNNI2P48788 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI2P48788 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI2P48788 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI2P48788 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI2P48788 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI2P48788 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI2P48788 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI2P48788 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI2P48788 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI2P48788 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI2P48788 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI2P48788 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI2P48788 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI2P48788 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI2P48788 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI2P48788 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI2P48788 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI2P48788 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI2P48788 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms