Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms