Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms