Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGP37231 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGP37231 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGP37231 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGP37231 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGP37231 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGP37231 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGP37231 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGP37231 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGP37231 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGP37231 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGP37231 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGP37231 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGP37231 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGP37231 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGP37231 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGP37231 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGP37231 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGP37231 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGP37231 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGP37231 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGP37231 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGP37231 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGP37231 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGP37231 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGP37231 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGP37231 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PPARGP37231 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PPARGP37231 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PPARGP37231 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PPARGP37231 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PPARGP37231 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PPARGP37231 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PPARGP37231 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PPARGP37231 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PPARGP37231 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PPARGP37231 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PPARGP37231 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PPARGP37231 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PPARGP37231 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PPARGP37231 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PPARGP37231 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PPARGP37231 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PPARGP37231 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PPARGP37231 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PPARGP37231 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms