Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms