Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFNP31947 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms