Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP1P29466 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP1P29466 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP1P29466 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP1P29466 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP1P29466 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP1P29466 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP1P29466 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP1P29466 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP1P29466 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP1P29466 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP1P29466 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP1P29466 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP1P29466 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP1P29466 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP1P29466 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP1P29466 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP1P29466 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP1P29466 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP1P29466 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP1P29466 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP1P29466 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP1P29466 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP1P29466 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP1P29466 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP1P29466 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP1P29466 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP1P29466 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP1P29466 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP1P29466 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP1P29466 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP1P29466 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP1P29466 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP1P29466 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP1P29466 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP1P29466 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms