Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms