Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms