Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms