Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BRAFP15056 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRAFP15056 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms