Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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SFTPCP11686 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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SFTPCP11686 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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SFTPCP11686 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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SFTPCP11686 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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SFTPCP11686 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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SFTPCP11686 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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