Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms