Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUX2O14529 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUX2O14529 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUX2O14529 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUX2O14529 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUX2O14529 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUX2O14529 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUX2O14529 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUX2O14529 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUX2O14529 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUX2O14529 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUX2O14529 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUX2O14529 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUX2O14529 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUX2O14529 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUX2O14529 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUX2O14529 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 OR52X1P-201ENST00000446117 914 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 SELENOK-205ENST00000541726 814 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 AL157871.2-201ENST00000556212 552 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 METTL22-203ENST00000561758 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 NR0B1-201ENST00000378963 475 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 HNRNPA1P73-201ENST00000446472 928 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CUX2O14529 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CUX2O14529 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUX2O14529 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUX2O14529 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUX2O14529 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUX2O14529 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUX2O14529 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUX2O14529 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUX2O14529 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUX2O14529 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUX2O14529 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUX2O14529 MBIP-211ENST00000621657 1809 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUX2O14529 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUX2O14529 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUX2O14529 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUX2O14529 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUX2O14529 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUX2O14529 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUX2O14529 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUX2O14529 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUX2O14529 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUX2O14529 IGFL4-201ENST00000377697 573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUX2O14529 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CUX2O14529 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CUX2O14529 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUX2O14529 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUX2O14529 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CUX2O14529 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CUX2O14529 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CUX2O14529 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUX2O14529 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUX2O14529 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUX2O14529 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUX2O14529 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUX2O14529 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CUX2O14529 AC124944.3-201ENST00000607976 1304 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CUX2O14529 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUX2O14529 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUX2O14529 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms