Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms