Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms