Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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COPS3Q9UNS2 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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COPS3Q9UNS2 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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COPS3Q9UNS2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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COPS3Q9UNS2 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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COPS3Q9UNS2 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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COPS3Q9UNS2 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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