Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms