Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TMEM30AQ9NV96 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TMEM30AQ9NV96 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TMEM30AQ9NV96 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TMEM30AQ9NV96 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TMEM30AQ9NV96 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TMEM30AQ9NV96 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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TMEM30AQ9NV96 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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TMEM30AQ9NV96 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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TMEM30AQ9NV96 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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TMEM30AQ9NV96 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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