Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CIPCQ9C0C6 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CIPCQ9C0C6 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CIPCQ9C0C6 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CIPCQ9C0C6 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CIPCQ9C0C6 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CIPCQ9C0C6 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CIPCQ9C0C6 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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