Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 LMO3-212ENST00000535535 1488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 CASC19-229ENST00000641418 1373 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AL031058.1-201ENST00000561592 888 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AC133485.6-201ENST00000624045 688 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms