Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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IFT27Q9BW83 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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IFT27Q9BW83 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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IFT27Q9BW83 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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IFT27Q9BW83 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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IFT27Q9BW83 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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IFT27Q9BW83 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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IFT27Q9BW83 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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IFT27Q9BW83 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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IFT27Q9BW83 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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