Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
HIGD2AQ9BW72 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
HIGD2AQ9BW72 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
HIGD2AQ9BW72 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
HIGD2AQ9BW72 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
HIGD2AQ9BW72 KDM7A-201ENST00000397560 9272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
HIGD2AQ9BW72 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
HIGD2AQ9BW72 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
HIGD2AQ9BW72 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
HIGD2AQ9BW72 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
HIGD2AQ9BW72 FREM3-201ENST00000329798 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
HIGD2AQ9BW72 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 LCMT2-201ENST00000305641 6957 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 CEP170-203ENST00000366543 6727 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 RAB3IP-212ENST00000550536 9646 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 TIAM1-206ENST00000541036 7018 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 DNAH10OS-201ENST00000514254 5040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 KLB-201ENST00000257408 6082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms