Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms