Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AL031430.1-201ENST00000642067 1039 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 FAM86FP-201ENST00000338711 969 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms