Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TUBGCP5Q96RT8 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms